Hồi Sinh Thuật Phần 3 sau một năm đã trôi qua kể từ chiến thắng vang dội của Subaru tại Sanctuary. Subaru, Emilia và các đồng đội đang tận hưởng cuộc sống bình yên và chuẩn bị cho những kế hoạch tiếp theo.
Tuy nhiên, hạnh phúc chỉ mới ngắn ngủi thì một lá thư bí ẩn xuất hiện từ Anastasia – một ứng cử viên khác cho ngôi vị hoàng hậu, cô ấy đã mời Emilia đến Thành phố Watergate của Priestella.